|
Abiotrophia spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Acinetobacter spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Actinomycètes aérobies |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Bacillus spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Bartonella henselae |
Détection moléculaire
|
Détection moléculaire par PCR |
|
Bartonella spp. |
Détection moléculaire
|
Détection moléculaire par PCR |
|
Burkholderia cepacia |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Chlamydia trachomatis - Lymphogranulome vénérien (LGV) |
Sérologie
|
Micro-immunofluorescence (MIF) |
|
Chlamydia trachomatis - Non lymphogranulome vénérien (non-LGV) |
Sérologie
|
Micro-immunofluorescence (MIF) |
|
Chlamydophila pneumoniae |
Sérologie
|
Micro-immunofluorescence (MIF) |
|
Chlamydophila pneumoniae |
Détection moléculaire
|
Détection moléculaire par PCR |
|
Chlamydophila psittaci |
Détection moléculaire
|
Détection moléculaire par PCR |
|
Chlamydophila psittaci |
Sérologie
|
Micro-immunofluorescence (MIF) |
|
Complexe Burkholderia cepacia |
Empreintes génétiques
|
Typage génomique multilocus (MLST) |
|
Corynebacterium diphtheriae |
Service de Référence
|
Service d’analyse de la toxine diphthérique |
|
Corynebacterium pseudotuberculosis |
Service de Référence
|
Service d’analyse de la toxine diphthérique |
|
Corynebacterium spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Corynebacterium ulcerans |
Service de Référence
|
Service d’analyse de la toxine diphthérique |
|
Coryneforms |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Enterococcus spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Erysipelothrix rhusiopathiae |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Granulicatella spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Groupe Bacteriodes fragilis |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Groupe HACEK |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Lactobacillus spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Legionella pneumophila |
Génotypage
|
Génotypage par PCR |
|
Legionella spp. |
Identification
|
Identification |
|
Legionella spp. |
Isolement
|
Culture |
|
Leuconostoc spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Microorganismes Gram négatif fermentant (à l’exclusion des entérobactériacées) |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Microorganismes Gram négatif non fermentant (à l’exclusion des entérobactériacées) |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Moraxella catarrhalis |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Mycoplasma pneumoniae |
Détection moléculaire
|
Détection moléculaire par PCR |
|
Pasturella spp |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Pathogènes bactériens |
Séquençage
|
Séquençage du gène codant pour l’ARNr 16S dans du matériel clinique |
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Pathogènes bactériens peu courants |
Isolement
|
Isolement |
|
Pediococcus spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Pseudomonas spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Staphylococcus spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Stenotrophomonas maltophila |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Streptococcus spp.(excluant Streptocoque du groupe A et streptocoque du groupe B, S.pneumoniae) |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
|
Taxons non décrits ou difficiles à identifier |
Séquençage
|
Séquençage du gène codant pour l’ARNr 16S |
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Taxons non décrits ou difficiles à identifier |
Caractérisation des souches
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Identification par caractérisation complète |
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Tropheryma whipplei |
Détection moléculaire
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Détection moléculaire par PCR |