Détection moléculaire par PCR

Détection de Chlamydophila pneumoniae par PCR.

Lavage bronchoalvéolaire ou biopsie pulmonaire. Il nous est également possible d'analyser des échantillons d'aspirats nasopharyngés, d'expectorations et de liquide céphalorachidien, mais ce type d'échantillon n'est pas idéal pour l'analyse. Les écouvillons secs ne sont pas acceptés pour l'analyse; les écouvillons doivent toujours être envoyés dans le milieu de conservation approprié. Fournir au moins 1 ml d'échantillon liquide. Tous les échantillons devraient, de préférence, être envoyés dans des tubes à bouchon vissé faits de plastique résistant aux chocs et à la congélation-décongélation.

Le laboratoire expéditeur n'a aucun traitement supplémentaire à effectuer lorsque les échantillons sont prélevés selon les directives énoncées ci-dessus. Tous les échantillons devraient être conservés à une température de réfrigération (2 °C à 8 °C) ou congelés immédiatement après le prélèvement. Veiller à ce que les échantillons soient maintenus à la bonne température durant leur expédition au LNM (p. ex. les échantillons congelés doivent être expédiés sur de la glace sèche et les échantillons réfrigérés sur des blocs réfrigérants).

Suivre les méthodes d'échantillonnage aseptique normalisées au moment du prélèvement des échantillons et veiller à ce que le matériel clinique soit placé dans le milieu de conservation approprié.

Le laboratoire expéditeur n'a aucun traitement supplémentaire à effectuer lorsque les échantillons sont prélevés selon les directives énoncées ci-dessus. Tous les échantillons devraient être conservés à une température de réfrigération (2 °C à 8 °C) ou congelés immédiatement après le prélèvement. Veiller à ce que les échantillons soient maintenus à la bonne température durant leur expédition au LNM (p. ex. les échantillons congelés doivent être expédiés sur de la glace sèche et les échantillons réfrigérés sur des blocs réfrigérants).

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Les symptômes d'infection respiratoire (p. ex. bronchite et pneumonie atypique) évoquent une infection à C. pneumoniae. Cependant, cette dernière a aussi été associée à d'autres affections telles que les coronaropathies, l'asthme et la sarcoïdose¹.

Requête d’analyse de bactériologie spéciale dûment remplie, comprenant les renseignements sur le patient et l’information clinique pertinente. Si possible, joindre les résultats des tests de laboratoire effectués par le laboratoire local et/ou provincial.  La documentation doit comprendre les renseignements sur le contexte clinique ayant mené à soupçonner l'existence d'une infection à C. pneumoniae chez le patient.

 

Si le résultat d'une analyse effectuée par le laboratoire expéditeur est positif pour C. pneumoniae, il serait utile de l'indiquer dans les documents d'accompagnement, en précisant le type d'analyse.

L'ADN de tous les échantillons de C. pneumoniae reçus au LNM à des fins d'analyse par PCR est d'abord extrait à l'aide d'une trousse disponible sur le marché. Les résultats reposent sur une PCR en temps réel ciblant une séquence bien conservée du gène codant pour l'ARN ribosomique 16S appartenant à C. pneumoniae. Une PCR visant à détecter le gène codant pour la b-globine humaine est également effectuée dans le but d'analyser la qualité et l'intégrité de l'ADN; le résultat doit être positif.

12 jours civils. Il est important de noter que lorsqu'un grand nombre d'échantillons est reçu ou lorsque des tests doivent être répétés, le délai d'exécution peut être plus long.

1. Hardick J, Maldeis N, Throdore M, Wood BJ, Yang S, Lin S, Quinn T and Gaydos C. Real-Time PCR for Chlamydia pneumoniae utilizing the Roche Lightcycler and a 16SrRNA gene target. (2004), Journal of Molecular Diagnostics 6(2):132-136.