Abiotrophia spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Acinetobacter spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Actinomycètes aérobies |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Bacillus spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Bartonella henselae |
Détection moléculaire
|
Détection moléculaire par PCR |
Bartonella spp. |
Détection moléculaire
|
Détection moléculaire par PCR |
Burkholderia cepacia |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Chlamydia trachomatis - Lymphogranulome vénérien (LGV) |
Sérologie
|
Micro-immunofluorescence (MIF) |
Chlamydia trachomatis - Non lymphogranulome vénérien (non-LGV) |
Sérologie
|
Micro-immunofluorescence (MIF) |
Chlamydophila pneumoniae |
Sérologie
|
Micro-immunofluorescence (MIF) |
Chlamydophila pneumoniae |
Détection moléculaire
|
Détection moléculaire par PCR |
Chlamydophila psittaci |
Détection moléculaire
|
Détection moléculaire par PCR |
Chlamydophila psittaci |
Sérologie
|
Micro-immunofluorescence (MIF) |
Complexe Burkholderia cepacia |
Empreintes génétiques
|
Typage génomique multilocus (MLST) |
Corynebacterium diphtheriae |
Service de Référence
|
Service d’analyse de la toxine diphthérique |
Corynebacterium pseudotuberculosis |
Service de Référence
|
Service d’analyse de la toxine diphthérique |
Corynebacterium spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Corynebacterium ulcerans |
Service de Référence
|
Service d’analyse de la toxine diphthérique |
Coryneforms |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Enterococcus spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Erysipelothrix rhusiopathiae |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Granulicatella spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Groupe Bacteriodes fragilis |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Groupe HACEK |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Lactobacillus spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Legionella pneumophila |
Génotypage
|
Génotypage par PCR |
Legionella spp. |
Identification
|
Identification |
Legionella spp. |
Isolement
|
Culture |
Leuconostoc spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Microorganismes Gram négatif fermentant (à l’exclusion des entérobactériacées) |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Microorganismes Gram négatif non fermentant (à l’exclusion des entérobactériacées) |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Moraxella catarrhalis |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Mycoplasma pneumoniae |
Détection moléculaire
|
Détection moléculaire par PCR |
Pasturella spp |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Pathogènes bactériens |
Séquençage
|
Séquençage du gène codant pour l’ARNr 16S dans du matériel clinique |
Pathogènes bactériens peu courants |
Isolement
|
Isolement |
Pediococcus spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Pseudomonas spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Staphylococcus spp. |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Stenotrophomonas maltophila |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Streptococcus spp.(excluant Streptocoque du groupe A et streptocoque du groupe B, S.pneumoniae) |
Épreuve de sensibilité
|
Épreuve de sensibilité aux antimicrobiens de certains aérobies, anaérobies facultatifs et anaérobies stricts |
Taxons non décrits ou difficiles à identifier |
Séquençage
|
Séquençage du gène codant pour l’ARNr 16S |
Taxons non décrits ou difficiles à identifier |
Caractérisation des souches
|
Identification par caractérisation complète |
Tropheryma whipplei |
Détection moléculaire
|
Détection moléculaire par PCR |