Sélection de la langue

YOU ARE USING THE CNPHI QA SYSTEM (LIBERTY)
English

Différenciation des espèces du complexe M. tuberculosis (CMTB) par méthode moléculaire

<<Retourner aux résultats de la recherche

Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Distinguer les organismes du complexe Mycobacterium tuberculosis au moyen de l'analyse des séquences d'une combinaison de gènes. Le CMTB constitue un groupe d'organismes génétiquement apparentés qui comprend M. tuberculosis (y compris M. tuberculosis subsp canettii), M. bovis, M. bovis BCG, M. africanum, M. caprae, M. microti et M. pinnipedii.

Catégorie d'analyse:
Différenciation moléculaire
Agent pathogène:
Mycobacterium tuberculosis
Infections et maladies:
  • Tuberculose (TB)
Spécimen:

La croissance sur milieu solide ou sous forme liquide. Pour la croissance sur milieu solide, on préfère les colonies isolées sur milieu en boîte de Pétri. Pour les cultures sous forme liquide, un volume minimum de 4 mL de culture en croissance active est souhaitable. La croissance du complexe Mycobacterium tuberculosis doit être visible et ne doit pas dépasser l'âge de 6 semaines.

Expédier toutes les cultures à température ambiante (NE PAS congeler) pour livraison le lendemain, et avant le mercredi de chaque semaine pour s'assurer qu'elles soient livrées au plus tard le vendredi.

Méthode de prélèvement:

S/O

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Expédier toutes les cultures à température ambiante (NE PAS congeler) pour livraison le lendemain, et avant le mercredi de chaque semaine pour s'assurer qu'elles soient livrées au plus tard le vendredi.

Transport des marchandises dangereuses:
L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.
Critères relatifs aux patients:

Néant

Documents d'accompagnement:

Les réquisitions doivent être transmises par télécopieur ((204) 789-2036) à l'attention de Joyce Wolfe, Gestionnaire du programme, CNRM/LNM, avant de procéder à l'expédition des isolats au CNRM. La réquisition du CNRM et la requête d'analyse pour typage des isolats de complexe M. tuberculosis doivent être complétées, signées par le superviseur/ou la personne désignée du laboratoire expéditeur et inclure l'origine du spécimen, le sexe et la date de naissance du patient, l'histoire clinique et l'informations sur l'identifiant du laboratoire et la personne-ressource (requérant). ). Il est aussi nécessaire d'inclure des caractéristiques connues des isolats: la microscopie, la pigmentation, les caractéristiques des cultures, la vitesse et température de croissance, et l'identification. Les demandes d'analyse urgente doit être accompagnée d'une justification.

Commentaires:

Les cultures acheminées seront rejetées et elles devront être expédiées de nouveau si la croissance est inadéquate ou en présence de contamination. Les cultures seront également éliminées si les documents et la justification sont incomplets ou manquants.

Méthodes et interprétation des résultats:

L'identification de l'espèce sera réalisée par une analyse de la séquence des objectifs génétiques, au besoin. L'identification se fera par une comparaison des données de séquençage aux séquences contenues dans une base de données dont la qualité est contrôlée à l'interne.

Délai d'exécution:

Demandes urgentes : 4 jours civils à partir de la date de réception de l'échantillon. Tests courants avec mise en culture : 10 jours civils à partir de la date de réception de l'échantillon.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-6038
Télécopieur: (204) 789-2036
Références:

1. Niemann S, Harmsen D, Rusch-Gerdes S, and Richter E. (2000) Differentiation of Clinical Mycobacterium tuberculosis Complex Isolates by gyrB DNA Sequence Polymorphism Analysis. J. Clin. Microbiol. 38:3231-3234.

2. Huard RC, de Oliveira Lazzarini LC, Butler WR, van Soolingen D, and Ho JL. (2003) PCR-Based Method To Differentiate the Subspecies of the Mycobacterium tuberculosis Complex on the Basis of Genomic Deletions. J. Clin. Microbiol. 41:1637.

3. Frothingham, R. (1995). Differentiation of Strains in Mycobacterium tuberculosis Complex by DNA Sequence Polymorphisms, Including Rapid Identification of M. bovis BCG. J. Clin. Micrbiol. 33:840-844.

4. Akos Somoskovi, Jillian Dormandy, Linda M Parsons, Michel Kaswa, Khye Seng Goh, Nalin Rastogi, Max Salfinger. Sequencing of the pncA gene in members of the Mycobacterium tuberculosis complex has important diagnostic applications: Identification of a species-specific pncA Mutation in Mycobacterium canettii, and the Reliable and Rapid Predictor of Pyrazinamide Resistance. J Clin Microbiol. 2006 Nov 29; : 17135430 (P,S,E,B)

5. Kamerbeek J, Schouls L, Kolk A, van-Agterveld M, van-Soolingen D, Kuijper S, Bunschoten A, Molhuizen H, Shaw R, Goyal M, and van-Embden J. (1997) Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology. J.Clin.Microbiol. 35:907-914.

Lignes directrices: