Génotypage par RT-PCR

Génotypage du virus de l'hépatite E à l'aide d'une épreuve RT-PCR conventionnelle suivie d'unséquençage.

Échantillon de sérum ou de plasma. Volume minimum requis pour le sérum ou le plasma: 1,0 mL.

Congeler les échantillons jusqu'au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur glace sèche.

Prélever le sang dans des tubes de séparation du sérum (TSS) ou tubes EDTA.

Congeler les échantillons jusqu'au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur glace sèche.

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Infection par le virus de l'hépatite E présumée. Les résultats sérologiques doivent indiquer les marqueurs du virus de l'hépatite E.

Requête pour diagnostiques immunologique et moléculaire de l'hépatite complétée incluant le nom, l'adresse et le numéro de téléphone de l'expéditeur. Le nom du patient ou identificateur (# du laboratoire qui le réfère), la date de naissance, l'exposition présumée, le(s) test(s) demandé(s). Nature du spécimen et date de prélèvement. Si possible, fournir l'histoire clinique et les résultats d'analyses qui ont été effectuées par les laboratoires locaux ou provinciaux.

Épreuve RT-PCR conventionnelle avec plusieurs (jusqu'à 5) pairesd'amorces amplifiant toutes les régions de l'ORF3 et de l'ORF2 des génotypes du VHE.

19 jours civils.

1. Zhai L, Dai X, Meng J. Hepatitis E virus genotyping based on full-length genome and partial genomic regions. Virus Res. 2006 Sep;120(1-2):57-69.
2. Inoue J, Takahashi M, Yazaki Y, Tsuda F, Okamoto H. Development and validation of an improved RT-PCR assay with nested universal primers for detection of hepatitis E virus strains with significant sequence divergence. J Virol Methods. 2006 Nov;137(2):325-33.