Génotypage par RT-PCR

Génotypage du virus de l’hépatite A à l’aide d’une RT-PCR conventionnelle suivi du séquençage de l’ADN.

Sérum, plasma ou échantillon de selles. Volume minimum requis pour le sérum ou le plasma est de 1.0 mL ou environ 1.0 gramme de selles pour préparer une suspension contenant 20% de selles.

Congeler les échantillons jusqu’au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur glace sèche.

Prélever le sang dans des tubes de séparation du sérum (TSS) ou tubes EDTA.Prélever l’échantillon de selles et congeler. Optionnel : préparer une suspension contenant 20% de selles et congeler immédiatement.

Congeler les échantillons jusqu’au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur glace sèche.

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Infection par le virus de l’hépatite A présumée. Le résultat sérologique doit être positif aux IgM anti-VHA.

Requête pour diagnostiques immunologique et moléculaire de l’hépatite complétée incluant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone de l’expéditeur. Le nom du patient ou identifiant (# du laboratoire qui le réfère), la date de naissance, l’exposition présumée, le(s) test(s) demandé(s). Nature du spécimen et date de prélèvement. Si possible, fournirl’histoire clinique et les résultats d’analyses qui ont été effectuées par les laboratoires locaux ou provinciaux.

Amplification par RT-PCR conventionnelle de la jonction VP1/2A suivi du séquençage.

19 jours civils.

1. Nainan OV, Xia G, Vaughan G, Margolis HS. Diagnosis of hepatitis a virus infection: a molecular approach. Clin Microbiol Rev. 2006 Jan;19(1):63-79.