Détection moléculaire de Francisella tularensis par PCR en temps réel

Détection moléculaire de Francisella tularensis par PCR en temps réel.

Culture pure, sang total – volume minimum requis 0.5 mL, liquide céphalo-rachidien (LCR) – volume minimum requis 0.5 mL, tissu de la biopsie, poudre.

Entreposer les échantillons de sang au réfrigérateur jusqu'à ce qu'ils soient expédiés aux fins d'analyse. Entreposer les échantillons de tissu et le LCR au congélateur jusqu'à ce qu'ils soient expédiés aux fins de test. Entreposer les cultures bactériennes au réfrigérateur jusqu'à ce qu'elles soient expédiées aux fins de test.

Culture bactérienne pure – plaque ou écouvillon; Sang total – tube EDTA; Tissu ou LCR – soumettre dans un tube à prélèvement stérile; poudre – soumettre dans un microtube à centrifuger stérile de 2 ml avec joint torique.

Entreposer les échantillons de sang au réfrigérateur jusqu'à ce qu'ils soient expédiés aux fins d'analyse. Entreposer les échantillons de tissu et le LCR au congélateur jusqu'à ce qu'ils soient expédiés aux fins de test. Entreposer les cultures bactériennes au réfrigérateur jusqu'à ce qu'elles soient expédiées aux fins de test.

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Infection de Francisella tularensis soupconnée.

Requête pour L'Élaboration d'épreuves et diagnostic – microbiologie médicolégale complétée incluant le nom, l'adresse et le numéro de téléphone de l'expéditeur. Nom du patient ou identifiant (# du laboratoire qui le réfère), date de naissance, exposition présumée, test(s) demandé(s), histoire clinique. Type de spécimen et date de prélèvement. Si possible, inclure les antibiotiques administrés et les antécédents de voyage.

La PCR en temps réel est réalisée en utilisant des épreuves internes de différenciation moléculaire avec trois cibles spécifiques de Francisella tularensis. Une de ces trois cibles permet de faire une distinction entre les souches de type A et les souches de type B. Les tests de confirmation d'un échantillon dont les résultats de PCR en temps réel sont positifs pour F. tularensis comprennent les suivants : épreuve d'immunofluorescence directe, agglutination sur lame, analyse multilocus du polymorphisme des séquences répétées en tandem (MLVA), analyse des acides gras cellulaires (AGC) et séquençage du gène codant l'ARNr 16S. Tous les échantillons dont les résultats de PCR en temps réel sont négatifs pour F. tularensis sont soumis à une analyse des AGC et à un séquençage du gène codant l'ARNr 16S, pourvu que l'échantillon permette d'étudier la croissance bactérienne par culture.

4 jours civils pour un résultat préliminaire et 14 jours civils pour un résultat final.