Analyse des toxines - PCR

Analyse par PCR des gènes stx1*, stx2*, eaeA* et hlyA* de E. coli O157 :H7; et LT, ST, CNF1, CNF2, Eagg, Einv, CDT I, CDT II, CDT III et subAB de E. coli (non-O157:H7).

Isolat d'urine, de selles, de sang, d'origine environnementale ou alimentaire, ou autres.

Envoyer sous forme de croissance sur un milieu de culture ou dans un milieu de transport. Les microorganismes doivent être envoyés sous forme de cultures.

Isolat soumis sur milieu de culture.

Envoyer sous forme de croissance sur un milieu de culture ou dans un milieu de transport. Les microorganismes doivent être envoyés sous forme de cultures.

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Gastro-entérite (toxi-infection alimentaire), septicémie, infection ou autres.

Requête d'analyse pour les maladies entériques dûment complétée.

*Ce test est accrédité.

stx1, stx2 : shigatoxines, aussi connues sous le nom de vérotoxines (toxines sécrétées dans le milieu extracellulaire); elles causent des diarrhées sanguinolentes pouvant mener au syndrome hémolytique et urémique (SHU); la toxine Stx-2 est généralement associée à une maladie plus grave.

eaeA : intimine (protéine de la membrane externe); l’adhésion intime d’E. coli producteur de shigatoxines/E. coli entérohémorragique (ECST/ECEH) aux entérocytes est médiée en partie par le gène eae et se traduit par la formation d’une lésion attachante et effaçante (A-E) à la surface des cellules de l’intestin.

hlyA : hémolysine; le gène hylA code pour une entérohémolysine (Ehx), toxine formatrice de pores qui lyse les érythrocytes; l’hémolysine Ehx est toxique pour les cellules endothéliales et peut contribuer à l’apparition d’un SHU.

LT : entérotoxine thermolabile; habituellement la toxine LT-1 est plus fréquente dans les maladies humaines, mais la toxine LT-II a été isolée chez des cas humains de diarrhée à E. coli entérotoxinogène (ECET).

ST : entérotoxine thermostable; présente seule ou en association avec la toxine LT; plus fréquente dans les cas humains graves que la toxine LT seule; cause une diarrhée aqueuse.

CNF (1, 2) : toxine cytotoxique nécrosante; associée principalement à des souches pathogènes extra-intestinales causant des infections urinaires et des méningites; associée à la septicémie ou à la diarrhée.

Eagg : facteur d’adhérence agrégative (AAF) – indicateur de la présence d’E. coli entéroagrégatif (ECEA), qui ne sécrète pas de LT ni de ST, mais adhère aux cellules épithéliales d’une façon rappelant un empilement de briques; associé à des diarrhées aiguës et persistantes.

Einv : facteur invasif – indicateur de la présence d’E. coli entéro-invasif (cause des diarrhées aqueuses et la dysenterie).

CDT (I, II, III) : toxine CDT (Cytolethal Distending Toxin); isolée chez des cas d’infection gastro-intestinale, d’infection urinaire ou de sepsis; lien évoqué avec la diarrhée et la diarrhée sanguinolente.

subAB : cytotoxine subtilase; à l’origine d’hémorragies de l’intestin grêle et d’une maladie semblable au SHU qui provoque des lésions rénales, une anémie hémolytique, une thrombocytopénie, des lésions d’organes (foie, rate, cerveau) et a été associée à une leucocytose.

Identification par PCR des gènes codant pour les toxines et facteurs de virulence, basée sur les références et procédures d'utilisation normalisées suivantes.

7 jours civils (à moins d'un pré avis indiquant que l'échantillon est urgent)

1. Paton, A.W. and Paton, J. C. 1997. Detection and Characterization of Shiga Toxigenic Escherichia coli by using Multiplex PCR Assays for stx1, stx2, eaeA, Enterohemorrhagic E. coli hlyA, rfb0111, and rfb0157. J. of Clin. Micro. 36: 598- 602.
2. Pierard, D., Muyldermans, G., Moriau, L., Stevens, D., and Lauwers, S. 1998. Identification of New Verocytotoxin Type 2 Variant B-Subunit Genes in Human and Animal Escherichia coli Isolates. J. Clin. Microbiol. Nov;36(11):3317-3322.