Détection moléculaire et Génotypage

Génotypage par PCR en temps réel des sérovars de Chlamydia responsables du LGV PCR et séquençage direct d'échantillons de C. trachomatis ayant reçu une confirmation.

Culture positive pour Chlamydia ou échantillons rectaux, endocervicaux, urétraux, urinaires ou autres, y compris les pièces de biopsie provenant de patients dont la recherche de Chlamydia était positive, et les échantillons dans solution tampon APTIMA de GEN-PROBE. Le volume minimal requis est 1 mL.

Placer les brosses cytologiques ou les écouvillons dans 2 mL de milieu de transport. Les échantillons peuvent être conservés et expédiés réfrigérés au LNM dans les 48 h suivant le prélèvement, sinon, ils doivent être conservés et expédiés congelés. Les pièces de biopsie fraîches doivent être conservées au congélateur en tout temps et expédiées sur de la glace sèche.

Écouvillon ou brosses cytologiques.

Placer les brosses cytologiques ou les écouvillons dans 2 mL de milieu de transport. Les échantillons peuvent être conservés et expédiés réfrigérés au LNM dans les 48 h suivant le prélèvement, sinon, ils doivent être conservés et expédiés congelés. Les pièces de biopsie fraîches doivent être conservées au congélateur en tout temps et expédiées sur de la glace sèche.

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Le service est offert pour les cas de LGV soupçonnée. La recherche du C. trachomatis par PCR dans les échantillons doit avoir donné un résultat positif. Les échantillons pour C. trachomatis ne sont pas acceptés sauf lorsque prévu dans le cadre d'une étude conjointe.

La requête d'analyse pour « ITS virales, polyome et herpèsvirus » comprend, pour l'expéditeur, le nom, l'adresse et le numéro de téléphone et, pour le patient, le nom-code, la date de naissance, le sexe, le no de référence de l'échantillon, le type d'échantillon, la date de prélèvement, le test requis et toute autre information clinique pertinente.

S/O

La détection de souches de Chlamydia responsables du LGV dans des échantillons positifs pour Chlamydia s'effectue par PCR quantitative multiplex (1). La sensibilité analytique pour la détection du LGV est de 10 à 100 copies/réaction, alors que celle de la détection du plasmide cryptique est d'environ 100 copies/réaction. L'identité du sérovar est confirmée par amplification et séquençage du gène ompA. Si le produit de PCR est négatif pour le MOMP, on ne peut déterminer le sérovar. Le sérovar exact de C. trachomatis est consigné. Veuillez noter que cette méthode est moins sensible que les trousses de diagnostic qui sont disponibles et qu'elle ne convient pas au dépistage de l'infection à Chlamydia trachomatis.

10 jours civils et 21 jours civils pour la confirmation du LGV. Veuillez communiquer avec le laboratoire pour vous renseigner sur les délais d'exécution plus courts.

1. Chen CY, Chi KH, Alexander S, Ison CA, Ballard RC. A real-time quadriplex PCR assay for the diagnosis of rectal lymphogranuloma venereum and non-lymphogranuloma venereum Chlamydia trachomatis infections. Sex Transm Infect. 2008 Aug;84(4):273-6.