Identification phénotypique et moléculaire
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Détails de la référence
Identification phénotypique et moléculaire de Campylobacter spp.
Épreuves utilisées : tests biochimiques*; PCR-RFLP pour Campylobacter*; PCR spécifique pour C. jejuni*; PCR spécifique pour C. coli *; séquençage du gène codant pour l’ARNr 16S*; MALDI-TOF; PCR pour C. fetus.
- Campylobactériose
Isolat d’urine, de selles, de sang, d’origine environnementale ou alimentaire, ou autres.
Envoyer le milieu de culture (avec croissance) ou dans un milieu de transport. Les spécimens pour analyse de Campylobacter doivent être envoyés dans le milieu de transport approprié. Les microorganismes doivent être envoyés sous forme de cultures.
Isolat sur milieu de culture.
Envoyer le milieu de culture (avec croissance) ou dans un milieu de transport. Les spécimens pour analyse de Campylobacter doivent être envoyés dans le milieu de transport approprié. Les microorganismes doivent être envoyés sous forme de cultures.
Gastro-entérite (toxi-infection alimentaire), septicémie, infection ou autres.
Requête d’analyse pour les maladies entériques dûment complétée.
*Ces tests ont été accrédités selon la norme CAN-P-4E (ISO/IEC 17025:2005).
L’identification phénotypique des agents pathogènes entériques est basée sur les références et les procédures opératoires normalisées (PON) qui suivent. Les méthodes moléculaires (PCR, RFLP, séquençage) servent à confirmer les résultats des tests phénotypiques (MALDI-TOF, biochimiques) et à identifier les espèces difficiles ou rares des genres Campylobacter.
21 jours civils.
- Griffiths and Park, 1990. A Review: Campylobacters Associated with Human Diarrhoeal Disease. J Appl Bacteriol, 69:281 - 301. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2672.1990.tb01519.x/pdf
- On, 2001 Taxonomy of Campylobacter, Arcobacter, Helicobacter and Related Bacteria: Current Status, Future Prospects and Immediate Concerns. J Appl Micro, 90:1S - 15S. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1046/j.1365-2672.2001.01349.x/pdf
- Lastovica et al., 2006. Emerging Campylobacter spp. the Tip of the Iceberg. Clin Micro Newsletter, 28:49 – 56. http://download.journals.elsevierhealth.com/pdfs/journals/0196-4399/PIIS0196439906000110.pdf
- Robinson, 1981. Infective Dose of Campylobacter jejuni in Milk. Br Med J, 282:1584.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1505544/pdf/bmjcred00658-0026a.pdf
- Alispahic et al., 2010. Species-Specific Identification and Differentiation of Arcobacter, Helicobacter and Campylobacter by Full-Spectral Matrix-Associated Laser Desorption / Ionization Time of Flight Mass Spectrometry Analysis. J Med Micro, 59:295 - 301. http://jmm.sgmjournals.org/content/59/3/295.full.pdf
- Lior, 1984. New, Extended Biotyping Scheme for Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, and "Campylobacter laridis". J Clin Micro, 20:636 - 640. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC271400/pdf/jcm00123-0066.pdf
- On and Holmes, 1991. Effect of Inoculum Size on the Phenotypic Characterization of Campylobacter Species. J Clin Micro, 29:923 – 926. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC269909/pdf/jcm00041-0102.pdf
- On and Holmes, 1991. Reproducibility of Tolerance Tests That Are Useful in the Identification of Campylobacteria. J Clin Micro, 29:1785 - 1788. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC270211/pdf/jcm00045-0053.pdf
- On, 1996. Identification Methods for Campylobacters, Helicobacters, and Related Organisms. Clin Micro Reviews, 9:405 - 422. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC172901/pdf/090405.pdf
- Melito et al., 2001. Helicobacter winghamensis sp. nov., a Novel Helicobacter sp. Isolated from Patients with Gastroenteritis. J Clin Micro, 39:2412 - 2417. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC88163/pdf/jm002412.pdf
- Marshall et al., 1999. Rapid Identification of Campylobacter, Arcobacter, and Helicobacter Isolates by PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism Analysis of the 16S rRNA Gene. J Clin Micro, 37:4158 – 4160. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC85910/pdf/jm004158.pdf
- Linton et al., 1997. PCR Detection, Identification to Species Level, and Fingerprinting of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli Direct from Diarrheic Samples. J Clin Micro, 35:2568 - 2572. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC230012/pdf/352568.pdf
- Hum et al., 1997. Evaluation of a PCR Assay for Identification and Differentiation of Campylobacter fetus Subspecies. Aust Vet J, 75:827 - 31. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9404619
- Melito et al., 2001. Helicobacter winghamensis sp. nov., a Novel Helicobacter sp. Isolated from Patients with Gastroenteritis. J Clin Micro, 39:2412 - 2417. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC88163/pdf/jm002412.pdf