Détection moléculaire de Burkholderia mallei/pseudomallei par PCR en temps réel
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Détection moléculaire de Burkholderia mallei/pseudomallei par PCR en temps réel.
- Morve
Sang total – volume minimum requis 0.5 mL, liquide céphalo-rachidien (LCR) – volume minimum requis 0.5 mL, tissu de la biopsie, poudre. Culture bactérienne pure – plaque ou écouvillon; Sang total – tube EDTA; Tissu ou LCR – soumettre dans un tube à prélèvement stérile; poudre – soumettre dans un microtube à centrifuger stérile de 2 ml avec joint torique.
Entreposer les échantillons de sang au réfrigérateur jusqu'à ce qu'ils soient expédiés aux fins d'analyse. Entreposer les échantillons de tissu et le LCR au congélateur jusqu'à ce qu'ils soient expédiés aux fins de test. Entreposer les cultures bactériennes au réfrigérateur jusqu'à ce qu'elles soient expédiées aux fins de test.
Sang total – tube EDTA; Tissu ou LCR – soumettre dans un tube à prélèvement stérile; poudre – soumettre dans un microtube à centrifuger stérile de 2 ml avec joint torique.
Entreposer les échantillons de sang au réfrigérateur jusqu'à ce qu'ils soient expédiés aux fins d'analyse. Entreposer les échantillons de tissu et le LCR au congélateur jusqu'à ce qu'ils soient expédiés aux fins de test. Entreposer les cultures bactériennes au réfrigérateur jusqu'à ce qu'elles soient expédiées aux fins de test.
Infection de Burkholderia pseudomallei/mallei soupconnée
Requête pour l'élaboration d'épreuves et diagnostic – microbiologie médicolégale complétée incluant le nom, l'adresse et le numéro de téléphone de l'expéditeur. Nom du patient ou identifiant (# du laboratoire qui le réfère), date de naissance, exposition présumée, test(s) demandé(s), histoire clinique. Type de spécimen et date de prélèvement. Si possible, inclure les antibiotiques administrés et les antécédents de voyage.
La PCR en temps réel est réalisée en utilisant des épreuves internes de différenciation moléculaire permettant de faire une distinction entre Burkholderia pseudomallei et Burkholderia mallei. *Note – Si la PCR en temps réel détecte Burkholderia mallei, aucun autre test ne peut être exécuté par BADD. L'échantillon est alors transmis à l'ACIA en vue d'autres tests. Les tests de confirmation d'un échantillon dont les résultats de PCR en temps réel sont positifs pour B. pseudomallei comprennent les suivants : sensibilité à la gentamicine, réduction des nitrates, analyse des acides gras cellulaires (AGC) et séquençage du gène codant l'ARNr 16S. Tous les échantillons dont les résultats de PCR en temps réel sont négatifs pour B. pseudomallei sont soumis à une analyse des AGC et à un séquençage du gène codant l'ARNr 16S, pourvu que l'échantillon permette d'étudier la croissance bactérienne par culture.
4 jours civils pour un résultat préliminaire et 14 jours civils pour un résultat final.